Akcja gry rozgrywa się w małej wiosce, leżącej w głębi Pradawnych Stepów, u stóp monstrualnego Abattoir. Przez wieki jej mieszkańcy odizolowali się od reszty świata i prowadząc spokojny żywot, nie interesowali się tym, co dzieje się na zewnątrz. Sielanka nie może jednak trwać wiecznie. Nagle wiejską społeczność zaatakował niewidzialny przeciwnik. Pierwszej nocy dramatu giną dwie osoby, a każda kolejna zbiera coraz większe, krwawe żniwo.W tym momencie do akcji wkracza troje bohaterów. Każde z nich trafia do przeklętej wioski z innej przyczyny, wszystkich jednak połączy tragizm miejscowej społeczności i rozgrywające się w dramatycznym tempie wydarzenia. Pierwszym z nich jest Bachelor, wybitnie wyedukowana persona, przysłana przez lokalne władze w celu zbadania źródła problemu i ewentualnego poskromienia go. Ripper to z kolei ogromnie zasłużony chirurg, który do wioski dociera przypadkiem, próbując odnaleźć ojcowskie dziedzictwo. Ostatnim śmiałkiem jest ekscentryczna dziewczyna Karla, posiadająca mistyczne zdolności lecznicze, której pomoc okazałaby się zbawienna dla mieszkańców wioski, gdyby nie jej tajemnicze lęki przed strasznymi wydarzeniami z przeszłości.Program zdecydowanie stawia na specyficzną atmosferę. Miasto, powoli wykańczane przez niewidzialnego przeciwnika, utrzymuje nas w klimacie ciągłego niebezpieczeństwa. Grając w Pathologic będziesz świadkiem przerażających obrazów agonii miasteczka, nieuchronnego końca zainfekowanego świata i dramatycznych tragedii przeklętych ludzi. Oczywiście, gra każdą postacią będzie się zasadniczo różnić, na co duży wpływ ma swoboda w postępowaniu gracza. Co ciekawsze, wszyscy trzej bohaterowie działają niezależnie, jeśli wybierzemy np. Bachelora, dwaj pozostali śmiałkowie sterowani przez komputer toczyć będą własne śledztwo, nierzadko uprzykrzając życie graczowi.Akcja przedstawiona jest z perspektywy pierwszej osoby w całkowicie trójwymiarowym środowisku. Mimo, że w grze znajduje się dużo elementów zręcznościowych, autorzy zdecydowanie postawili na przygodowy charakter rozgrywki, ubarwiając ją naleciałościami z tradycyjnych RPG. Wszystko to przy akompaniamencie rozbudowanej ścieżki dźwiękowej, która znakomicie uzupełnia specyficzny nastrój grozy, utrzymującej się w miasteczku.