Apocalyptica to dynamiczna, trójwymiarowa gra akcji przepełniona motywami biblijnymi. Rzecz toczy się w odległej przyszłości, po tym jak siły dobra zesłały na Ziemię biblijny Armageddon, który zniszczył znajdującego się tam Szatana wraz z jego armią upadłych. Od tego czasu wyznawcy dobra patrolowali przestrzeń kosmiczną w trosce o to, by Szatan nie powrócił, i by ponownie nie doprowadził ludzkości na skraj zagłady. Jednak po millenniach pokoju władca zła odrodził się jako Neo-Szatan gotowy za wszelką cenę zemścić się, na tych którzy poprzednio go unicestwili. Na przedsionek samego piekła wybrał składającą się wyłącznie z popiołów Ziemię, nazywając ją Nu-Hades i zaczął gromadzić armię, która ma podbić świat.Gracz staje się jednym z czterech wojowników dobra (m.in. futurystyczny Templariusz i futurystyczna Zakonnica), którzy mają za zadanie pokonać Neo-Szatana. Każdy z owych bohaterów charakteryzuje się innymi współczynnikami osobowymi, tj. siłą ognia, umiejętnością walki wręcz, poziomem wiary i szybkością poruszania się. Wykorzystuje także inne rodzaje broni, w tym miecze: Hand of God, Restoration Sword, oraz broń laserową: Blaster, Eye of God. W trybie rozgrywki jednoosobowej wybrana przez nas postać dowodzi oddziałem żołnierzy kontrolowanych przez komputerowe A.I. Nasza krucjata prowadzi przez cztery duże etapy składające się z licznych pomniejszych poziomów, tj. początkowo przeciwstawiamy się siłom zła na planecie Jeruzalem V, następnie na okręcie kosmicznym SS Ariziel, później na Ziemi (Nu-Hades), aż w końcu w samym Piekle. Całość składa się z szeregu misji, w których należy wypełnić z góry narzucone zadania, m.in. musimy zinfiltrować wrogą bazę, odeprzeć atak sił zła, czy też samemu przedrzeć się przez linie wroga. Poza rozgrywką w trybie single player istnieje możliwość gry w trybie multiplayer z żywymi graczami.