The Bridge Construction Set (znany też pod tytułem Pontifex II), to druga część gry, w której stajemy przed zadaniem konstrukcji mostów. Idea rozgrywki pozostała ta sama co w pierwszym Pontifexie, tzn. nadal łączymy dwa brzegi rzeki mostem własnej konstrukcji (używając do tego celu dostępnych środków finansowych i materiałów budowlanych), jednakże znacznie rozbudowano i poszerzono poszczególne elementy rozgrywki, w tym silnik fizyczny.Po uruchomieniu programu najbardziej rzuca się w oczy nowa trójwymiarowa grafika, znacznie ładniejsza i bardziej szczegółowa niż to miało miejsce poprzednio, jednakże nadal odbiegająca od topowych produkcji. Nie mniej jednak trzeba przyznać, iż znakomicie spełnia swoje zadanie (pojawiły się cienie, rozbłyski światła, itp.). Rozszerzono też możliwości budowy mostów i zwiększono ilość aspektów jakie należy wziąć pod uwagę przy ich konstrukcji. Teraz możemy na przykład konstruować mosty zwodzone i sprawdzać, czy nie spowodują utrudnień w żegludze i transporcie rzecznym. Do pociągu, którego używaliśmy do testów mostów w części pierwszej, dołączyły też inne pojazdy, m.in.: zwykłe samochody osobowe, ciężarowe (łącznie 15 różnych pojazdów korzystających z mostu) . Sam proces projektowania, konstrukcji i testowania pod obciążeniem mostów wygląda niemal identycznie jak to miało miejsce poprzednio, tzn. mamy dwa charakterystyczne brzegi rzeki jakie musimy połączyć, pewną ilość pieniędzy przeznaczoną na budowę mostu i szereg materiałów, które możemy wykorzystać w konstrukcji, jak: stal niskiej i wysokiej jakości, liny stalowe, itp. (w sumie sześć różnych materiałów). Po zbudowaniu mostu testujemy go pod obciążeniem oglądając rozkład sił i naprężeń na poszczególnych elementach. Jeżeli przejdzie testy, przechodzimy do kolejnego, trudniejszego etapu i konstruujemy kolejny most. Łącznie autorzy przygotowali dla graczy 40 poziomów do przejścia. Ponadto możemy tworzyć nowe poziomy używając zaimplementowanego edytora.Warto zaznaczyć, iż The Bridge Construction Set został zwycięzcą Festiwalu Niezależnych Gier w roku 2003.