Naruto: Ninja Council 3 to chodzona bijatyka, będąca częścią serii, powstałej w oparciu o kultowe anime, stworzone przez Masashiego Kishimoto. Zarówno gra, jak i jej kreskówkowy pierwowzór przedstawia potyczki tytułowego Uzumaki Naruto adepta sztuki ninjutsu. Niniejsza pozycja powstała wyłącznie z myślą o posiadaczach dwuekranowej konsoli ze stajni Nintendo, wykorzystując wszystkie jej atuty.Rozpoczynając zabawę użytkownik wybiera sterowaną postać z puli zawierającej ponad dwudziestu bohaterów. Wśród nich poza Uzumakim znajduje się m.in. Sasuke Uchiha, Sakura Haruno, Kakashi Hatake, Neji Hyuga, Rock Lee, Tenten i Might Guy. Każdy odznacza się odmiennym zestawem umiejętności i posiada typowy dla siebie styl walki. Przy podejmowaniu decyzji co do protagonisty należy zwrócić uwagę, jakie zdolności są wymagane do zaliczenia konkretnego poziomu. Stosując odpowiednie techniki, ma się sposobność wyposażenia postaci aktualnie kontrolowanej w cechy posiadane przez innych wojowników. Pozwala to na stworzenie zupełnie nowego stylu, stanowiącego najlepszą recepturę na ukończenie danego levelu.Grubo ponad czterdzieści misji umieszczono na przestrzeni piętnastu lokacji, doskonale znanych miłośnikom anime. Kilkakrotne zaliczanie poszczególnych zadań pozwala na doprowadzenie do perfekcji konkretnych kombinacji ciosów i bloków. Odpowiednio operując stylusem na panelu dotykowym czy dmuchając w mikrofon wykonuje się szereg ataków specjalnych - np. w przypadku Sasuke wykorzystuje się ogień.Poza zabawą w pojedynkę developerzy przygotowali też system potyczek wieloosobowych poprzez Wi-Fi. W trybie multiplayer nawet czterech użytkowników jednocześnie może zmierzyć swoje siły m.in. w walce bezpośredniej, bądź w starciu z czasem.