X-COM: Terror from the Deep to druga część stworzonego przez firmę MicroProse hitu pt. UFO: Enemy Unknown. Jego akcja rozpoczyna się w roku 2040, czyli 40 lat po wydarzeniach znanych z części pierwszej, kiedy to organizacja X-COM założona w celu obrony Ziemi przed atakami obcych pokonała najeźdźców. Lecz okazało się, że nie ostatecznie, ponieważ niektóre z zestrzelonych jednostek kosmitów spadły do oceanu i tam ocaleni stworzyli podwodne bazy, z których teraz ponownie atakują ludzi. Ziemia znowu staje przed śmiertelnym zagrożeniem tym razem skierowanym z głębin oceanu, a my jako głównodowodzący sił X-COM musimy wybudować i rozwinąć podwodne bazy oraz sformować nowe siły zbrojne, które przychwycą łodzie obcych, unicestwią ich załogi i dostarczą naszym naukowcom próbki do badań. Rozgrywka w stosunku do pierwowzoru nie uległa znacznym zmianom, zastosowano ten sam lekko ulepszony interfejs oraz unowocześniony engine graficzny. Zwiększyła się ilość gatunków obcych, technologii do wynalezienia oraz liczba typów wyposażenia, broni i gadżetów które mogą używać nasi żołnierze. Największym zaś atutem podobnie jak w UFO: Enemy Unknown pozostał klimat gry, który wraz z zaimplementowanymi nowościami przyczynił się jej sukcesu.