Cloning Clyde to platformówka, kładąca jednocześnie bardzo silny nacisk na logiczne myślenie i kreatywność. Wcielamy się w postać niejakiego Clydea, niczym nie wyróżniającego się człowieczka, który dał się skusić dwudziestoma dolarami do wzięcia udziału w eksperymencie, związanym z klonowaniem. Niestety dla nas, nie wszystko poszło zgodnie z planem, trzeba więc brać nogi za pas. Naszym zadaniem jest wyprowadzenie Clydea (a właściwie całej kolonii Clydeów), z terenu Dupliclone Lab, gdzie przetrzymują nas diaboliczni naukowcy.Żeby plan się udał musimy naszego bohatera rozruszać i zmusić do kreatywnego myślenia. Na szczęście w pomieszczeniach laboratorium nie brakuje naukowego sprzętu, który możemy wykorzystać. W trakcie ucieczki spotykamy również inne ofiary eksperymentów, szukające drogi wyjścia. I to jest właśnie klucz do sukcesu. Clyde, za pomocą specjalistycznych urządzeń, musi łączyć swoje geny z genami małp, żab, a nawet kurczaków! Umiejętnie wykorzystując możliwości poszczególnych zwierząt, pokonujemy kolejne przeszkody. W taki sposób uwalniamy Clydea. A potem następnego. I jeszcze jednego. I kolejnego...Autorzy dają nam do wyboru kilka opcji rozgrywki. W trybie single-player możemy wybrać Story Mode (przejście całej gry według scenariusza) lub spróbować swoich sił w pojedynczych misjach. Możliwa jest również gra wieloosobowa na podzielonym ekranie oraz zabawa online (kooperacja i rywalizacja).